Um einer offenen Plattform gerecht zu werden, arbeitet die wakeboX nach dem Client-Server-Prinzip. Der Client ist eine Java-Applikation, was eine plattformunabhängige Fernsteuerung der wakeboX ermöglicht.

Mit Hilfe einer FS20 Fernbedienung kann die wakeboX bequem und flexibel gesteuert werden. Alle Aktoren - sprich FS20-Empfänger, Audiosteuerungsparameter - können einer Taste zugeordnet werden.

Seit Version 0.70 ist der wakeboX Server auch über handelsübliche Infrarot Multimedia Fernbedienungen (und sogar über angeschlossene Tastaturen und Mäuse) steuerbar. Analog zur FS20 Fernbedienung kann die wakeboX auch hiermit bequem und flexibel gesteuert werden. Alle Aktionen wie beispielsweise FS20-Empfänger schalten, MP3-Player steuern oder auch Abläufe starten können beliebigen Tasten der Fernbedienung zugeordnet werden.

Das USB-Bedienteil mit LCD Display wird über ein USB-Kabel am Mini-PC angeschlossen und kann mit Hilfe der von hier auf wakeboX.de abrufbarem Schaltplan gerne nachgebaut werden.